I miracoli di natura sono gesti compiuti sulle cose o sugli elementi della natura. Tra questi segni troviamo:

- La trasformazione dell'acqua in vino (Gv. 2, 1-11)
- Il miracolo dei pani e dei pesci (Gv. 6, 1-1; Mt. 14, 13-21;15,32-39; Mc. 6, 32-44; Lc. 9,10-17 e 8,1-9)
- La pesca miracolosa (Lc. 5,4-11; Gv. 21, 3-10)
- La camminata di Gesù sulle acque (Mt. 14, 22-33 ; Mc. 6, 45-52 ; Gv. 6, 16-21)
- La tempesta sedata (Mt. 8,23-27; Mc. 4, 35-41; Lc. 8, 22-25)
- La maledizione del fico sterile (Mt. 21,18-22; Mc. 11, 12-14.20-24; Lc. 13, 6-9)